三乘合体变形金刚GO！动漫全集讲述的是汽车人总司令官·擎天柱及领袖卫队和霸天虎的战斗还在持续着，因霸天虎科学参谋·震荡波的实验而被再现的远古塞博特恩生物：巨狰狞却发生了暴走，其中最为强悍的几只巨狰狞逃到了地球，虽然擎天柱等人历经艰辛终于封印了其中最强的恶鬼大帝·冲云霄，但却不得不回到和霸天虎的战场上，追击其余巨狰狞的任务就交给了被称为刀剑太保的两组新汽车人小队，他们从战国时代就沉睡在日本，现在将被人类的少年唤醒，阻止巨狰狞干部·四鬼众复活冲云霄的计划，保护具有神秘力量的传说之碟，并将全部的巨狰狞再度封印。